Univerzitet u Tartuu (estonski: Tartu Ülikool; ruski: Тартуский университет; njemački: Universität Tartu) je javni univerzitet u gradu Tartuu u baltičkoj republici Estoniji. Univerzitet je jedini klasični, a ujedno i najveći i najprestižniji univerzitet u zemlji. Univerzitet je osnovao Gustav Adolf od Švedske 1632. godine. Najveći broj studijskih programa izvodi se na estonskom jeziku, uz pojedine iznimke kao što je studijski program Evropska unija i Ruski studiji.