TRPM5

Ідентифікатори

Символи

TRPM5, LTRPC5, MTR1, transient receptor potential cation channel subfamily M member 5

Зовнішні ІД

OMIM: 604600 MGI: 1861718 HomoloGene: 22818 GeneCards: TRPM5

Реагує на сполуку

steviol, Rebaudioside A, stevioside, flufenamic acid, гідрон, spermine^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • potassium channel activity • calcium activated cation channel activity • sodium channel activity
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • мембрана • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • integral component of membrane
Біологічний процес	• ion transport • sodium ion transmembrane transport • sensory perception of taste • calcium ion transmembrane transport • potassium ion transmembrane transport • cation transport • regulation of ion transmembrane transport • ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


29850


56843

Ensembl


ENSG00000070985


ENSMUSG00000009246

UniProt


Q9NZQ8


Q9JJH7

RefSeq (мРНК)


NM_014555


NM_020277

RefSeq (білок)


NP_055370


NP_064673

Локус (UCSC)

Хр. 11: 2.4 – 2.44 Mb

Хр. 7: 142.62 – 142.65 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPM5 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 165 амінокислот, а молекулярна маса — 131 451^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQDVQGPRPG	SPGDAEDRRE	LGLHRGEVNF	GGSGKKRGKF	VRVPSGVAPS
VLFDLLLAEW	HLPAPNLVVS	LVGEEQPFAM	KSWLRDVLRK	GLVKAAQSTG
AWILTSALRV	GLARHVGQAV	RDHSLASTST	KVRVVAVGMA	SLGRVLHRRI
LEEAQEDFPV	HYPEDDGGSQ	GPLCSLDSNL	SHFILVEPGP	PGKGDGLTEL
RLRLEKHISE	QRAGYGGTGS	IEIPVLCLLV	NGDPNTLERI	SRAVEQAAPW
LILVGSGGIA	DVLAALVNQP	HLLVPKVAEK	QFKEKFPSKH	FSWEDIVRWT
KLLQNITSHQ	HLLTVYDFEQ	EGSEELDTVI	LKALVKACKS	HSQEPQDYLD
ELKLAVAWDR	VDIAKSEIFN	GDVEWKSCDL	EEVMVDALVS	NKPEFVRLFV
DNGADVADFL	TYGRLQELYR	SVSRKSLLFD	LLQRKQEEAR	LTLAGLGTQQ
AREPPAGPPA	FSLHEVSRVL	KDFLQDACRG	FYQDGRPGDR	RRAEKGPAKR
PTGQKWLLDL	NQKSENPWRD	LFLWAVLQNR	HEMATYFWAM	GQEGVAAALA
ACKILKEMSH	LETEAEAARA	TREAKYERLA	LDLFSECYSN	SEARAFALLV
RRNRCWSKTT	CLHLATEADA	KAFFAHDGVQ	AFLTRIWWGD	MAAGTPILRL
LGAFLCPALV	YTNLITFSEE	APLRTGLEDL	QDLDSLDTEK	SPLYGLQSRV
EELVEAPRAQ	GDRGPRAVFL	LTRWRKFWGA	PVTVFLGNVV	MYFAFLFLFT
YVLLVDFRPP	PQGPSGPEVT	LYFWVFTLVL	EEIRQGFFTD	EDTHLVKKFT
LYVGDNWNKC	DMVAIFLFIV	GVTCRMLPSA	FEAGRTVLAM	DFMVFTLRLI
HIFAIHKQLG	PKIIVVERMM	KDVFFFLFFL	SVWLVAYGVT	TQALLHPHDG
RLEWIFRRVL	YRPYLQIFGQ	IPLDEIDEAR	VNCSTHPLLL	EDSPSCPSLY
ANWLVILLLV	TFLLVTNVLL	MNLLIAMFSY	TFQVVQGNAD	MFWKFQRYNL
IVEYHERPAL	APPFILLSHL	SLTLRRVFKK	EAEHKREHLE	RDLPDPLDQK
VVTWETVQKE	NFLSKMEKRR	RDSEGEVLRK	TAHRVDFIAK	YLGGLREQEK
RIKCLESQIN	YCSVLVSSVA	DVLAQGGGPR	SSQHCGEGSQ	LVAADHRGGL
DGWEQPGAGQ	PPSDT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14323 (англ.) . Архів оригіналу за 17 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9NZQ8 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані