TRPV4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4DX1, 4DX2

Ідентифікатори

Символи

TRPV4, BCYM3, CMT2C, HMSN2C, OTRPC4, SMAL, SPSMA, SSQTL1, TRP12, VRL2, VROAC, transient receptor potential cation channel subfamily V member 4

Зовнішні ІД

OMIM: 605427 MGI: 1926945 HomoloGene: 11003 GeneCards: TRPV4

Пов'язані генетичні захворювання

spondylometaphyseal dysplasia, Kozlowski type, metatropic dysplasia, Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2C, spondyloepiphyseal dysplasia, Maroteaux type, parastremmatic dwarfism, familial digital arthropathy-brachydactyly, neuromuscular disease, scapuloperoneal spinal muscular atrophy, autosomal dominant congenital benign spinal muscular atrophy^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • stretch-activated, cation-selective, calcium channel activity • osmosensor activity • microtubule binding • alpha-tubulin binding • SH2 domain binding • calmodulin binding • actin filament binding • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-tubulin binding • cation channel activity • actin binding • ATP binding • protein kinase binding • protein kinase C binding • calcium channel activity • lipid binding • identical protein binding • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• integral component of membrane • cell projection • мембрана • focal adhesion • Філоподія • growth cone • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • ruffle membrane • cell surface • міжклітинні контакти • apical plasma membrane • cortical actin cytoskeleton • cytoplasmic microtubule • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • lamellipodium • integral component of plasma membrane • війка • ендоплазматичний ретикулум
Біологічний процес	• actin cytoskeleton reorganization • cell volume homeostasis • cellular response to heat • positive regulation of inflammatory response • negative regulation of neuron projection development • glucose homeostasis • cellular hypotonic salinity response • positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 1 production • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • calcium ion import • positive regulation of monocyte chemotactic protein-1 production • response to mechanical stimulus • negative regulation of brown fat cell differentiation • osmosensory signaling pathway • cellular calcium ion homeostasis • hyperosmotic salinity response • microtubule polymerization • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of JNK cascade • cellular hypotonic response • ion transport • vasopressin secretion • cellular response to osmotic stress • regulation of response to osmotic stress • diet induced thermogenesis • response to osmotic stress • response to insulin • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of vascular permeability • calcium ion transmembrane transport • cortical microtubule organization • positive regulation of chemokine (C-C motif) ligand 5 production • cell-cell junction assembly • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • hypotonic response • positive regulation of macrophage inflammatory protein 1 alpha production • blood vessel endothelial cell delamination • multicellular organismal water homeostasis • positive regulation of macrophage chemotaxis • calcium ion transport • positive regulation of microtubule depolymerization • actin filament organization • трансмембранний транспорт • cartilage development involved in endochondral bone morphogenesis • energy homeostasis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


59341


63873

Ensembl


ENSG00000111199


ENSMUSG00000014158

UniProt


Q9HBA0


Q9EPK8

RefSeq (мРНК)


NM_001177428 NM_001177431 NM_001177433 NM_021625 NM_147204


NM_022017

RefSeq (білок)


NP_001170899 NP_001170902 NP_001170904 NP_067638 NP_671737


NP_071300

Локус (UCSC)

Хр. 12: 109.78 – 109.83 Mb

Хр. 5: 114.76 – 114.8 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPV4 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 871 амінокислот, а молекулярна маса — 98 281^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADSSEGPRA	GPGEVAELPG	DESGTPGGEA	FPLSSLANLF	EGEDGSLSPS
PADASRPAGP	GDGRPNLRMK	FQGAFRKGVP	NPIDLLESTL	YESSVVPGPK
KAPMDSLFDY	GTYRHHSSDN	KRWRKKIIEK	QPQSPKAPAP	QPPPILKVFN
RPILFDIVSR	GSTADLDGLL	PFLLTHKKRL	TDEEFREPST	GKTCLPKALL
NLSNGRNDTI	PVLLDIAERT	GNMREFINSP	FRDIYYRGQT	ALHIAIERRC
KHYVELLVAQ	GADVHAQARG	RFFQPKDEGG	YFYFGELPLS	LAACTNQPHI
VNYLTENPHK	KADMRRQDSR	GNTVLHALVA	IADNTRENTK	FVTKMYDLLL
LKCARLFPDS	NLEAVLNNDG	LSPLMMAAKT	GKIGIFQHII	RREVTDEDTR
HLSRKFKDWA	YGPVYSSLYD	LSSLDTCGEE	ASVLEILVYN	SKIENRHEML
AVEPINELLR	DKWRKFGAVS	FYINVVSYLC	AMVIFTLTAY	YQPLEGTPPY
PYRTTVDYLR	LAGEVITLFT	GVLFFFTNIK	DLFMKKCPGV	NSLFIDGSFQ
LLYFIYSVLV	IVSAALYLAG	IEAYLAVMVF	ALVLGWMNAL	YFTRGLKLTG
TYSIMIQKIL	FKDLFRFLLV	YLLFMIGYAS	ALVSLLNPCA	NMKVCNEDQT
NCTVPTYPSC	RDSETFSTFL	LDLFKLTIGM	GDLEMLSSTK	YPVVFIILLV
TYIILTFVLL	LNMLIALMGE	TVGQVSKESK	HIWKLQWATT	ILDIERSFPV
FLRKAFRSGE	MVTVGKSSDG	TPDRRWCFRV	DEVNWSHWNQ	NLGIINEDPG
KNETYQYYGF	SHTVGRLRRD	RWSSVVPRVV	ELNKNSNPDE	VVVPLDSMGN
PRCDGHQQGY	PRKWRTDDAP	L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, війках.

Література

Strotmann R., Harteneck C., Nunnenmacher K., Schultz G., Plant T.D. (2000). OTRPC4, a nonselective cation channel that confers sensitivity to extracellular osmolarity. Nat. Cell Biol. 2: 695—702. PMID 11025659 DOI:10.1038/35036318
Suzuki M., Mizuno A., Kodaira K., Imai M. (2003). Impaired pressure sensation in mice lacking TRPV4. J. Biol. Chem. 278: 22664—22668. PMID 12692122 DOI:10.1074/jbc.M302561200
Arniges M., Fernandez-Fernandez J.M., Albrecht N., Schaefer M., Valverde M.A. (2006). Human TRPV4 channel splice variants revealed a key role of ankyrin domains in multimerization and trafficking. J. Biol. Chem. 281: 1580—1586. PMID 16293632 DOI:10.1074/jbc.M511456200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Strotmann R., Schultz G., Plant T.D. (2003). Ca2+-dependent potentiation of the nonselective cation channel TRPV4 is mediated by a C-terminal calmodulin binding site. J. Biol. Chem. 278: 26541—26549. PMID 12724311 DOI:10.1074/jbc.M302590200
Garcia-Elias A., Lorenzo I.M., Vicente R., Valverde M.A. (2008). IP3 receptor binds to and sensitizes TRPV4 channel to osmotic stimuli via a calmodulin-binding site. J. Biol. Chem. 283: 31284—31288. PMID 18826956 DOI:10.1074/jbc.C800184200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPV4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18083 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9HBA0 (англ.) . Архів оригіналу за 13 червня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані