EGR2

EGR2
Ідентифікатори
Символи EGR2, AT591, CMT1D, CMT4E, KROX20, early growth response 2, CHN1
Зовнішні ІД OMIM: 129010 MGI: 95296 HomoloGene: 20123 GeneCards: EGR2
Пов'язані генетичні захворювання
Charcot-Marie-Tooth disease type 4E, Charcot-Marie-Tooth disease type 1D[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
HMG box domain binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
chromatin binding
зв'язування з іоном металу
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
nucleic acid binding
ubiquitin protein ligase binding
transferase activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
SUMO ligase activity

Клітинна компонента

цитоплазма
клітинне ядро
нуклеоплазма
внутрішньоклітинна мембранна органела

Біологічний процес

cellular response to organic substance
rhythmic behavior
peripheral nervous system development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
rhombomere 3 development
brain segmentation
transcription by RNA polymerase II
protein sumoylation
rhombomere 3 formation
transcription, DNA-templated
response to insulin
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
brain development
rhombomere 5 formation
protein export from nucleus
learning or memory
skeletal muscle cell differentiation
Schwann cell differentiation
regulation of neuronal synaptic plasticity
myelination
facial nerve structural organization
regulation of ossification
motor neuron axon guidance
fat cell differentiation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1959
13654
Ensembl
ENSG00000122877
ENSMUSG00000037868
UniProt
P11161
P08152
RefSeq (мРНК)
NM_000399
NM_001136177
NM_001136178
NM_001136179
NM_001321037
NM_010118
NM_001347458
RefSeq (білок)
NP_000390
NP_001129649
NP_001129650
NP_001129651
NP_001307966
NP_001334387
NP_034248
NP_001360912
NP_001360914
NP_001360915
NP_001360916
Локус (UCSC) Хр. 10: 62.81 – 62.82 Mb Хр. 10: 67.54 – 67.54 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EGR2 (англ. Early growth response 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 50 302[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMTAKAVDKIPVTLSGFVHQLSDNIYPVEDLAATSVTIFPNAELGGPFDQ
MNGVAGDGMINIDMTGEKRSLDLPYPSSFAPVSAPRNQTFTYMGKFSIDP
QYPGASCYPEGIINIVSAGILQGVTSPASTTASSSVTSASPNPLATGPLG
VCTMSQTQPDLDHLYSPPPPPPPYSGCAGDLYQDPSAFLSAATTSTSSSL
AYPPPPSYPSPKPATDPGLFPMIPDYPGFFPSQCQRDLHGTAGPDRKPFP
CPLDTLRVPPPLTPLSTIRNFTLGGPSAGVTGPGASGGSEGPRLPGSSSA
AAAAAAAAAYNPHHLPLRPILRPRKYPNRPSKTPVHERPYPCPAEGCDRR
FSRSDELTRHIRIHTGHKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFAC
DYCGRKFARSDERKRHTKIHLRQKERKSSAPSASVPAPSTASCSGGVQPG
GTLCSSNSSSLGGGPLAPCSSRTRTP

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Rangnekar V.M., Aplin A.C., Sukhatme V.P. (1990). The serum and TPA responsive promoter and intron-exon structure of EGR2, a human early growth response gene encoding a zinc finger protein. Nucleic Acids Res. 18: 2749—2757. PMID 2111009 DOI:10.1093/nar/18.9.2749
  • Luciano R.L., Wilson A.C. (2003). HCF-1 functions as a coactivator for the zinc finger protein Krox20. J. Biol. Chem. 278: 51116—51124. PMID 14532282 DOI:10.1074/jbc.M303470200
  • Garcia-Gutierrez P., Juarez-Vicente F., Gallardo-Chamizo F., Charnay P., Garcia-Dominguez M. (2011). The transcription factor Krox20 is an E3 ligase that sumoylates its Nab coregulators. EMBO Rep. 12: 1018—1023. PMID 21836637 DOI:10.1038/embor.2011.152

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з EGR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3239 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  5. UniProt, P11161 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 10
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші