ID2

ID2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4AYA

Ідентифікатори
Символи ID2, GIG8, ID2A, ID2H, bHLHb26, inhibitor of DNA binding 2, HLH protein, inhibitor of DNA binding 2
Зовнішні ІД OMIM: 600386 MGI: 96397 HomoloGene: 1632 GeneCards: ID2
Онтологія гена
Молекулярна функція

protein dimerization activity
transmembrane transporter binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
transcription factor binding

Клітинна компонента

клітинне ядро
гіалоплазма
цитоплазма
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
ритмічний процес
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle
multicellular organism development
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
metanephros development
natural killer cell differentiation
thigmotaxis
leukocyte differentiation
membranous septum morphogenesis
bundle of His development
heart development
циркадний ритм
adult locomotory behavior
entrainment of circadian clock
GO:1901313 positive regulation of gene expression
negative regulation of gene expression
oligodendrocyte development
regulation of lipid metabolic process
olfactory bulb development
circadian regulation of gene expression
mammary gland epithelial cell proliferation
regulation of circadian rhythm
entrainment of circadian clock by photoperiod
enucleate erythrocyte differentiation
negative regulation of DNA binding
locomotor rhythm
negative regulation of B cell differentiation
positive regulation of fat cell differentiation
positive regulation of erythrocyte differentiation
positive regulation of macrophage differentiation
negative regulation of neuron differentiation
negative regulation of osteoblast differentiation
positive regulation of blood pressure
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
розвиток клітин
cell maturation
Peyer's patch development
embryonic digestive tract morphogenesis
positive regulation of smooth muscle cell proliferation
neuron fate commitment
cell morphogenesis involved in neuron differentiation
positive regulation of astrocyte differentiation
negative regulation of oligodendrocyte differentiation
adipose tissue development
mammary gland alveolus development
epithelial cell differentiation involved in mammary gland alveolus development
endodermal digestive tract morphogenesis
cellular response to lithium ion
клітинне старіння
negative regulation of neural precursor cell proliferation
neuron differentiation
regulation of cell cycle

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3398
15902
Ensembl
ENSG00000115738
ENSMUSG00000020644
UniProt
Q02363
P41136
RefSeq (мРНК)
NM_002166
NM_010496
RefSeq (білок)
NP_002157
NP_034626
Локус (UCSC) Хр. 2: 8.68 – 8.68 Mb Хр. 12: 25.14 – 25.15 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ID2 (англ. Inhibitor of DNA binding 2, HLH protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 134 амінокислот, а молекулярна маса — 14 917[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKAFSPVRSVRKNSLSDHSLGISRSKTPVDDPMSLLYNMNDCYSKLKELV
PSIPQNKKVSKMEILQHVIDYILDLQIALDSHPTIVSLHHQRPGQNQASR
TPLTTLNTDISILSLQASEFPSELMSNDSKALCG

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Biggs J., Murphy E.V., Israel M.A. (1992). A human Id-like helix-loop-helix protein expressed during early development. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1512—1516. PMID 1741406 DOI:10.1073/pnas.89.4.1512
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ward S.M., Fernando S.J., Hou T.Y., Duffield G.E. (2010). The transcriptional repressor ID2 can interact with the canonical clock components CLOCK and BMAL1 and mediate inhibitory effects on mPer1 expression. J. Biol. Chem. 285: 38987—39000. PMID 20861012 DOI:10.1074/jbc.M110.175182

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5361 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.[недоступне посилання з жовтня 2019]
  4. UniProt, Q02363 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші