NR1H3

NR1H3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1UHL, 3IPQ, 3IPS, 3IPU, 5AVI, 5AVL, 5HJS

Ідентифікатори
Символи NR1H3, LXR-a, LXRA, RLD-1, Liver X receptor alpha, nuclear receptor subfamily 1 group H member 3
Зовнішні ІД OMIM: 602423 MGI: 1352462 HomoloGene: 21165 GeneCards: NR1H3
Пов'язані генетичні захворювання
метаболічні захворювання[1]
Реагує на сполуку
(25R)-cholest-5-ene-3β,26-diol, desmosterol[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

cholesterol binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
zinc ion binding
GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
sterol response element binding
steroid hormone receptor activity
DNA binding
sequence-specific DNA binding
зв'язування з іоном металу
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001105 transcription coactivator activity
GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
transcription factor binding
nuclear receptor coactivator activity
signaling receptor activity

Клітинна компонента

receptor complex
нуклеоплазма
RNA polymerase II transcription regulator complex
клітинне ядро
цитоплазма

Біологічний процес

positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway
sterol homeostasis
negative regulation of pancreatic juice secretion
negative regulation of inflammatory response
cellular response to lipopolysaccharide
negative regulation of lipid transport
positive regulation of lipoprotein lipase activity
lipid homeostasis
triglyceride homeostasis
negative regulation of macrophage activation
negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation
positive regulation of cholesterol transport
negative regulation of cholesterol storage
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of triglyceride biosynthetic process
positive regulation of cholesterol efflux
GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process
negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway
regulation of circadian rhythm
transcription, DNA-templated
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
response to progesterone
steroid hormone mediated signaling pathway
apoptotic cell clearance
positive regulation of fatty acid biosynthetic process
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of secretion of lysosomal enzymes
negative regulation of pinocytosis
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
intracellular receptor signaling pathway
cholesterol homeostasis
lipid metabolism
multicellular organism development
диференціація клітин
negative regulation of cold-induced thermogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10062
22259
Ensembl
ENSG00000025434
ENSMUSG00000002108
UniProt
Q13133
Q9Z0Y9
RefSeq (мРНК)
NM_001130101
NM_001130102
NM_001251934
NM_001251935
NM_005693
NM_001177730
NM_013839
NM_001355279
RefSeq (білок)
NP_001123573
NP_001123574
NP_001238863
NP_001238864
NP_005684
NP_001350524
NP_005684.2
NP_001171201
NP_038867
NP_001342208
Локус (UCSC) Хр. 11: 47.25 – 47.27 Mb Хр. 2: 91.01 – 91.03 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NR1H3 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group H member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 447 амінокислот, а молекулярна маса — 50 396[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSLWLGAPVPDIPPDSAVELWKPGAQDASSQAQGGSSCILREEARMPHSA
GGTAGVGLEAAEPTALLTRAEPPSEPTEIRPQKRKKGPAPKMLGNELCSV
CGDKASGFHYNVLSCEGCKGFFRRSVIKGAHYICHSGGHCPMDTYMRRKC
QECRLRKCRQAGMREECVLSEEQIRLKKLKRQEEEQAHATSLPPRASSPP
QILPQLSPEQLGMIEKLVAAQQQCNRRSFSDRLRVTPWPMAPDPHSREAR
QQRFAHFTELAIVSVQEIVDFAKQLPGFLQLSREDQIALLKTSAIEVMLL
ETSRRYNPGSESITFLKDFSYNREDFAKAGLQVEFINPIFEFSRAMNELQ
LNDAEFALLIAISIFSADRPNVQDQLQVERLQHTYVEALHAYVSIHHPHD
RLMFPRMLMKLVSLRTLSSVHSEQVFALRLQDKKLPPLLSEIWDVHE

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з NR1H3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Nuclear receptor subfamily 1 group H member 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7966 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  6. UniProt, Q13133 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші